Чтобы заработал enhancer от DataNucleus нужно в NetBeans
Project Properties -> Build / Compiling -> Turn Off "Compile on Save"

jsecurity

Разобрался с jsecurity (который сейчас Апач Ки - apache ki)

документация слабая.
Лучше делать так:

1. Смотреть исходники, запустить под дебагом и вкуривать
2. Просмотреть что написано здесь
   

hibernate+mysql+autocommit

Отключаем AUTOCOMMIT

1. в файле hibernate.cfg.xml указываем:
false

2. когда создаем табличку указываем тип InnoDB

CREATE TABLE (...) TYPE=InnoDB;